Lennule registreerimine lennujaamas on tasuta ja seda saab teha 60-180 minutit enne väljumist.
Online-registreerimist saab teha 3-72 tundi enne väljumist ettevõtte veebilehel või Pegasus Airlinesi mobiilirakenduse kaudu. Lisaks on Istanbuli lennujaamas saadaval iseteeninduskioskid.